Ich bin mit Flask und SQLAlchemy auf dasselbe SQLite/Postgres-Problem gestoßen, ähnlich wie bei Gordon Fierce. Allerdings war meine Lösung anders. Postgres ist streng in Bezug auf Tabellensperren und -verbindungen, daher hat das explizite Schließen der Sitzungsverbindung beim Teardown das Problem für mich gelöst.
Mein Arbeitscode:
@pytest.yield_fixture(scope='function')
def db(app):
# app is an instance of a flask app, _db a SQLAlchemy DB
_db.app = app
with app.app_context():
_db.create_all()
yield _db
# Explicitly close DB connection
_db.session.close()
_db.drop_all()
Referenz:SQLAlchemy