Die einfachste Lösung (abhängig von Ihren spezifischen Anforderungen) wäre wahrscheinlich das Hinzufügen eines Triggers zum Aktualisieren/Einfügen/Löschen zu Ihrer Tabelle, sodass Sie eine zusätzliche Protokollierung durchführen können, wenn Daten eingefügt/aktualisiert/gelöscht werden. So werden auch manuelle Eingriffe an der db abgedeckt...
Überprüfen Sie http://dev.mysql.com/doc/refman/ 5.1/en/triggers.html für weitere Informationen.