PHP-PDO-Mehrfachauswahlabfrage löscht konsequent das letzte Rowset

Ich denke, Sie verkomplizieren die Dinge mit Ihrer Do/While-Schleife.

Probieren Sie stattdessen eine einfache While-Schleife aus:

$pdo = /* connection stuff here */
$sql = "select 1; select 2; select 3; select 4;";
$statement = $pdo->query($sql);

while($rowset = $statement->fetchAll()){
    //do stuff

    $statement->nextRowset();
}

Dies wird die Schleife fortsetzen, während das Rowset keinen falschen Wert hat, der dann genau so funktionieren sollte, wie Sie es erwarten.