Die Antwort ist also einfach. Es scheint, dass Sie die von MKJ angegebene Änderung verpasst haben ^^, aber die tatsächliche Syntax zum Ändern Ihrer Tabellen sieht so aus.
alter table `dbname`.`tablename` convert to character set utf8 collate utf8_general_ci;
Als einzelnes Skript oder am Ende Ihrer create table-Anweisung angewendet, sollten Sie in der Lage sein, alle verwandten Tabellen wieder auf denselben Zeichensatz zu beziehen