Wenn Sie sie sicher löschen möchten, empfehle ich Ihnen, pt-duplicate-key-checker im Percona-Toolkit zu verwenden. Es generiert automatisch den Drop-Index-SQL für Sie.
Zu viele Indizes verringern die Leistung, insbesondere beim Aktualisieren und Einfügen. Sie sollten diese nutzlosen Indizes besser löschen.