UPDATE table AS t
JOIN table AS tt
ON t.initials = tt.initials
AND t.surname = tt.surname
AND t.company = tt.company
AND t.id > tt.id
SET t.active = 1;
Das heißt, aktualisieren Sie jede Zeile, wenn es eine andere Zeile mit einer niedrigeren ID, mit denselben Initialen, demselben Nachnamen und derselben Firma gibt.
Hier ist ein sqlfiddle dafür.