Schließlich habe ich dieses Problem behoben. Meine App verfügt über Multithread, um dieselbe Verbindung zu verwenden. Es scheint, dass dies kein geeigneter Weg ist, um auf mysql zuzugreifen. Wenn ich also keine Verbindung teile, ist das Problem behoben.
Unter 'threadSafety' im MySQLdb-Benutzerhandbuch :