Versuchen Sie, die Unterabfrage durch einen Join zu ersetzen:
SELECT *
FROM files f
LEFT OUTER JOIN reades r on r.file_id = f.file_id
WHERE r.file_id IS NULL
Hier ist ein Link zu einem Artikel über dieses Problem . Der Autor dieses Artikels schrieb eine gespeicherte Prozedur, um MySQL zu zwingen, Unterabfragen als unabhängig zu bewerten. Ich bezweifle jedoch, dass das in diesem Fall notwendig ist.