Ich weiß nicht, wie Sie die CSVs importieren, aber ich würde ein Skript (php/perl) schreiben, um jede Datei zu lesen, den Zeitstempel auf Sekunden aufzurunden oder zu kürzen und INSERT-Anweisungen auf der DATABASE auszuführen.
So etwas wie
<?php
$file=fopen("your.csv","r");
mysql_connect ($ip, $user, $pass);
while(!feof($file))
{
$line = explode(',',fgets($file));
mysql_query("INSERT INTO TABLE1 (ID, DATE) values (".$line[0].", ".substr($line[1],0,19).")");
}
fclose($file);
?>
Führen Sie dies von der Befehlszeile aus und es sollte den Job erledigen