ulimit -a löste das Rätsel:
core file size (blocks, -c) 1
data seg size (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority (-e) 0
file size (blocks, -f) unlimited
pending signals (-i) 30619
max locked memory (kbytes, -l) 64
max memory size (kbytes, -m) 3338968
open files (-n) 1024
pipe size (512 bytes, -p) 8
POSIX message queues (bytes, -q) 819200
real-time priority (-r) 0
stack size (kbytes, -s) 8192
cpu time (seconds, -t) unlimited
max user processes (-u) 30619
virtual memory (kbytes, -v) 6496960
file locks (-x) unlimited
Es funktionierte, nachdem die maximale Speichergröße und der virtuelle Speicher auf unbegrenzt eingestellt und alles neu gestartet wurde. BTW, die nächste Datei hatte wieder 2GB.
Entschuldigen Sie die Störung, aber ich war verzweifelt. Vielleicht hilft das jemandem, der mit einem ähnlichen Problem "googelt".
