Ich glaube ich hatte genau das gleiche Problem. Wenn ja, bestand meine Lösung darin, alle Einträge in web.config zu löschen, die auf ReportViewer verweisen, dann dasselbe in Referenzen zu tun, das Projekt zu erstellen und dann erneut einen Reportviewer auf der Seite hinzuzufügen.
web.config wird mit neuen Handlern und Assemblys für die neuere Version aktualisiert.
