Ich habe es schließlich so gemacht:
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Export zum Dump mit:
pg_dump -f dumpfile.sql --column-inserts -a -n <schema> -U <username> <dbname>
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Überspringen für alle Tabellen eindeutig festlegen
CREATE OR REPLACE RULE skip_unique AS ON INSERT TO <table> WHERE (EXISTS (SELECT 1 FROM <table> WHERE users.id = new.id)) DO INSTEAD NOTHING
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Mit
psql
importieren\i <dumpfile.sql>