Ich konnte mein Problem lösen, indem ich alle Bibliotheken (als Ubuntu-Pakete), den Python-Interpreter und den gesamten Code deinstallierte und dann neu installierte, indem ich die Datenbank neu generierte (einschließlich der Neuinstallation von Postgis) und dann nginx vollständig neu startete (und also Gunicorn). Es wurden jedoch keine Bibliotheken aktualisiert, daher verstehe ich immer noch nicht, was wirklich passiert ist.