Das offizielle Repository von PHP hat ein Skript namens docker-php-ext-install
https://github.com/docker-library/php/tree/master /5.6
Sie haben vergessen, die zum Ausführen des PDO erforderliche Erweiterung zu installieren.
Versuchen Sie, ein Docker-Image wie dieses zu erstellen:
FROM php:5.6-apache
# PHP extensions
RUN docker-php-ext-install pdo pdo_mysql pdo_pgsql