Nein. In MySQL sind „Datenbanken“ im Wesentlichen nur Kataloge, die keinen Einfluss darauf haben, wie Daten gespeichert oder abgefragt werden.
Das Abfragen von zwei Tabellen in verschiedenen Datenbanken ist vom Standpunkt der Abfrageausführung aus dasselbe wie das Abfragen von zwei Tabellen in derselben Datenbank.