Ich verstehe nicht ganz was die Frage ist? Können Sie erklären, was Sie wollen?
Wenn Sie Ihrer Ausgabe Trennzeichen hinzufügen möchten, müssen Sie CONCAT_WS verwenden :
mysql -u myuser -p mydb -e "select CONCAT_WS(',',f1,f2) from mytable" > /tmp/mydata.txt