select project_id, service_id, count(*) as count
from tbl group by project_id, service_id
order by count(*) desc
Fügen Sie einfach service_id hinzu zu Ihrer group by und select aufführen. Das sollte reichen.
BEARBEITEN -
Laut Kommentar von @Rajah Es scheint, dass Sie für Ihre erwartete Ausgabe
order by project_id asc, service_id asc
