Sie können das DATE_FORMAT verwenden Funktion in Ihren Auswahlen.
Für das Datum:
'%Y-%m-%d'
Für Zeit:
'%H:%i:%s'
Also sowas wie:
UPDATE `table`
SET `datetimecol` = CONCAT_WS(' ', DATE_FORMAT(`datecol`, '%Y-%m-%d'), DATE_FORMAT(`timecol`, '%H:%i:%s'))