Angenommen, es gibt keine Probleme mit CSV-Zitaten:
$newStr = str_replace( ',', '<br>', $string );
BEARBEITEN:
Nachdem ich Ihr Rollback gesehen habe, sehe ich, dass Sie eigentlich den , ersetzen möchten mit einem newline Zeichen wie \r , \n oder \r\n :
$newStr = str_replace( ',', "\n", $string );