Angenommen, die Spalte heißt „id“, entweder:
SELECT *
FROM tableA a
WHERE NOT EXISTS (SELECT 1 FROM tableB WHERE id = a.id)
oder
SELECT *
FROM TableA
WHERE id NOT IN (SELECT id FROM tableB)
Sie müssen wahrscheinlich testen, um zu sehen, welche die beste Leistung erbringt. MySQL kann etwas unberechenbar sein.