Die Abfrage sollte wie folgt aussehen, Sie haben dieselbe Tabelle beigetreten und daher das Problem des eindeutigen Alias. Ich habe Tabellenalias für bessere Lesbarkeit hinzugefügt.
UPDATE
sales_flat_order sfo
INNER JOIN sales_flat_order_grid sfog
ON sfog.entity_id = sfo.entity_id
SET sfo.coupon_code = "newcoupon"
WHERE sfog.increment_id = "12345678" ;