Dies ist mit RDS nicht möglich.
Sie können es "vortäuschen", indem Sie die Tabellen, die Sie nicht replizieren möchten, in Engine=Blackhole konvertieren, aber Sie müssen Ihre Parametergruppe bearbeiten und "schreibgeschützt" auf 0 setzen, anstatt auf den Standardwert "{TrueIfReplica}".
Alternativ müssten Sie Ihren eigenen Slave-Server auf EC2 mit dem RDS-Server als Master ausführen (dies ist möglich, wenn Sie MySQL 5.6 auf RDS ausführen, aber nicht 5.5 oder niedriger), jedoch ist die Einrichtung extrem kompliziert.