In Ihrer MySQL-Konfigurationsdatei (normalerweise /etc/mysql/my.cnf) sollten Sie eine datadir-Eigenschaft haben, die der Ort ist, an dem mysql seine Daten speichert
Etwas wie:
datadir = /var/lib/mysql
Anschließend erstellt es darin für jede Datenbank ein Unterverzeichnis, in dem der Datenbankinhalt gespeichert wird (z. B.:/var/lib/mysql/mydatabase). Soweit ich weiß, können Sie keine bestimmte Datenbank angeben, die außerhalb von datadir gespeichert werden soll.