Ok ich habe es gelöst. Ich habe mysql-connector-java-5.1.18-bin.jar
manuell eingefügt in meinem SDK-Ordner:
file:///opt/appengine-java-sdk-1.6.0/lib/impl/
Fehler ändert sich in ein komfortableres:
java.sql.SQLException: Access denied for user 'root'@'localhost' (using password: YES)
Vielen Dank jedoch für Vorschläge