Sie können nicht wirklich verschachtelte Ergebnisse erhalten, aber Sie könnten GROUP_CONCAT(DISTINCT store_items.ID ORDER BY ID) AS siIDs
verwenden um eine durch Kommas getrennte Liste von ID-Werten zu erhalten.
Sie können auch das Trennzeichen ändern
http://dev.mysql .com/doc/refman/5.7/en/group-by-functions.html#function_group-concat