Mysql
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Setzen Sie Prioritäten zwischen MySQL-Prozessen

Das klingt nach einem Datenbanksperrproblem. Ich würde empfehlen, sich ein Tool wie innotop zu besorgen und einen genauen Blick darauf werfen, was in der Datenbank passiert. Insbesondere würde ich einen sorgfältigen Blick auf offene Tabellen, Sperren und Abfragen werfen, die aktiv sind, wenn Ihre Grails-App ausgeführt wird.