Die WebSphere MQ-Persistenz ist immer ein lokales Dateisystem für verteilte Plattformen. Auf dem Mainframe gibt es die Möglichkeit, eine DB2-Datenbank in einem Sysplex mit einer Coupling Facility zu verwenden, aber für alles andere ist es ein Dateisystem.
Außerdem gibt es keine lokale Persistenz für WebSphere MQ-Clients. Nur der Warteschlangenmanager speichert Nachrichten.
In der WebSphere-Familie hat der System Integration Bus von WebSphere Application Server die Fähigkeit, eine Datenbank für seine Nachrichtenpersistenz zu verwenden. SIBus ist eine mit WAS bereitgestellte JMS-Implementierung zum Austauschen von Nachrichten in der WAS-Zelle und zwischen WAS-Instanzen.