Das ist nicht möglich, was Sie erreichen wollen.
Sie sollten eine Entität für die users_skills_levels erstellen. Z.B. UserSkillLevel Diese Entität hat dann eine ManyToOne-Beziehung zu User und eine ManyToOne-Beziehung zu Skills plus der Attributebene.
Der Benutzer hat auch eine Sammlung von UserSkillLevel und der Skill-Entität.
Ein ausführlicheres Beispiel finden Sie hier:
https://thoughts-on-java.org/many-relationships- zusätzliche Eigenschaften/