JDBI eignet sich nicht sehr gut zum Erstellen dynamischer Abfragen. Meiner Meinung nach besteht der ganze Sinn dieser Bibliothek darin, Code und SQL-Abfragen so weit wie möglich zu trennen.
Ihr spezieller Fall könnte jedoch mit SQL gelöst werden:
COALESCE(:foo, foo)
wenn 'foo' der Name der Spalte in der Tabelle ist und :foo zu NULL aufgelöst wird, dann ist mysql SET effektiv
SET foo=foo
dh es wird nichts tun (was in Ihrem Fall das gewünschte Verhalten ist). Wenn :foo nicht null ist, entspricht es
SET foo=:foo