Ich verstehe nicht, warum Sie den Index löschen müssen. Erstellen Sie es einfach einmal für die Rowid, wenn es nicht bereits als Primärschlüssel für jede dieser Tabellen definiert ist. In diesem Fall ist es bereits indiziert.
Anstatt Daten zu löschen und dann wieder einzufügen, könnten Sie vielleicht, wenn möglich, ein Update durchführen, das insgesamt schneller wäre.
