Vielleicht ein bisschen veraltet, aber zu diesem Zeitpunkt kann Express-Session die Domain-Option für Cookies erkennen. Laut Quelle:
function session(options){
var options = options || {}
// name - previously "options.key"
, name = options.name || options.key || 'connect.sid'
, store = options.store || new MemoryStore
, cookie = options.cookie || {}
...
Und dies dient zum Setzen von Cookies:
var Cookie = module.exports = function Cookie(options) {
this.path = '/';
this.maxAge = null;
this.httpOnly = true;
if (options) merge(this, options);
...
Also, so etwas funktioniert für den aktuellen 1.10.1-Master:
secret: "my secret",
cookie: {
domain: "mydomain.com",