Glücklicherweise mongodump 3.0 akzeptiert Optionen zum Überspringen bestimmter Sammlungen.
Dies löste mein Problem, keinen Administratorzugriff auf die Datenbank zu haben, um Berechtigungen zu optimieren. Bitte denken Sie daran, dass Sie keine vollständigen Backups mehr erstellen werden.
mongodump --excludeCollection=system.indexes
oder
mongodump --excludeCollectionsWithPrefix=system