MongoDB hat Javascript-Prozeduren gespeichert, aber keinen Scheduler.
http://docs.mongodb.org/manual/ tutorial/store-javascript-function-on-server/
Sie könnten dies von einem Client-Computer aus mit einem Cron-Job und der Mongo-Shell auslösen. Ich empfehle jedoch dringend, einfach ein Skript in Python oder einer ähnlichen clientseitigen Skriptsprache auszuführen. Versionskontrolle und Debugging sind viel einfacher als serverseitiges Javascript.