Sie können eine Einschränkung mit unique
hinzufügen Attribut. Dadurch wird Ihrer Sammlung auch ein "eindeutiger" Index für das Feld hinzugefügt:
var userSchema = mongoose.Schema({
username: { type: String, unique: true },
email: String,
password: String,
_todo: [{ type: mongoose.Schema.Types.ObjectId, ref: 'Todo'}]
});