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Spring Data MongoDB eliminiert POJOs

Ich glaube nicht, dass Sie es ohne Pojo tun können, wenn Sie Federdaten verwenden. Das Mindeste, was Sie tun könnten, ist dies

public interface NoPojoRepository extends MongoRepository<DummyPojo, String> {
}

und erstellen Sie ein Dummy-Pojo mit nur einer ID und einer Karte.

@Data
public class DummyPojo {
  @Id
  private String id;
  private Map<String, Object> value;
}

Da dieses Wertefeld eine Karte ist, können Sie so ziemlich alles speichern.