Ich hatte genau das gleiche Problem. Wie mir aufgefallen ist, trat das Problem nach dem Zusammenführen von .edmx-Dateien mit Subversion auf. Beim Betrachten der .edmx-Datei im Texteditor habe ich einen doppelten EntitySetMapping-Eintrag gefunden. Nach dem manuellen Löschen des Duplikats wurde das Problem gelöst! Hoffentlich hilft das weiter