Nun, für jede Zeile in "Gruppen" führt postgresql einen vollständigen Scan von products_categories durch, was nicht gut ist. Nicht unbedingt ein Konfigurationsproblem, aber vielleicht könnte die Abfrage ohne solche verschachtelten Unterabfragen angegeben werden?
SELECT count(DISTINCT "groups".id) AS count_all
FROM "groups"
WHERE exists(
select 1 from products p where groups.id = p.group_id
join products_categories pc on pc.product_id = p.id
where pc.category_id in (2,3)
) and groups.id <> 3
Auch products_categories
haben einen Index auf product_id
?