Kannst du sie nicht einfach durch ein Semikolon trennen?
Delete from messages where messageid = '1';
Delete from usersmessages where messageid = '1'
ODER
Verwenden Sie einfach INNER JOIN wie unten
DELETE messages , usersmessages FROM messages INNER JOIN usersmessages
WHERE messages.messageid= usersmessages.messageid and messages.messageid = '1'
