Verwenden Sie lsof -i TCP:3306 oder netstat -lp | grep 3306 um herauszufinden, was bereits auf Port 3306 lauscht - irgendetwas muss darauf lauschen.
Sie könnten in Betracht ziehen, den Server auf einen anderen Port zu starten (bearbeiten Sie my.cnf und ändern Sie dort den Standardport).
Möglicherweise müssen Sie dies als root ausführen, z. B. sudo lsof -i TCP:3306
