Obwohl mysqldump die häufig gemeldete Ursache dafür ist, ist es nicht die einzige.
In meinem Fall löst das Ausführen von artisan:migrate auf einer beliebigen Datenbank diesen Fehler auch für verschiedene Datenbanken auf demselben Server aus.
http://bugs.mysql.com/bug.php?id=42041 Erwähnt Tabellensperren/-löschen, die in einem mysqldump aufgerufen würden, also lohnt es sich zu prüfen, ob gleichzeitig Migrationen, Sperren oder Leerungen stattfinden.
Wenn dies fehlschlägt, versuchen Sie, die Vorbereitungen auf emuliert umzuschalten.
'options' => [
\PDO::ATTR_EMULATE_PREPARES => true
]