Ich nehme an, Ihr Problem ist, dass nur ein Dokument aktualisiert wird, richtig? Wenn dies der Fall ist, müssen Sie im dritten Parameter (dem options-Parameter) eine weitere Einstellung für die Update-Methode vornehmen:
multiple => true
Andernfalls wird nur die erste Übereinstimmung Ihrer Abfrage aktualisiert. Siehe die Dokumentation zur Update-Methode unter:
http://de.php.net/manual/en/mongocollection.update .php