Anscheinend verwenden Sie InnoDB Tabellen, daher sollten Sie auch ib*-Dateien in den Datenordner kopieren (dies überschreibt jedoch alle InnoDB-Tabellen, die bei einer Neuinstallation erstellt wurden.)
Alternativ (noch besser) können Sie den Parameter 'datadir' in der Konfigurationsdatei setzen und den Pfad zum Datenordner in der alten Installation angeben.