Was Sie eigentlich brauchen, ist die Archivierung der alten Daten. Ich würde vorschlagen, dass Sie sich diesen Thread auf der Mongodb-Mailingliste ansehen:
https://groups.google.com/forum/#!topic/mongodb-user/rsjQyF9Y2J4
Letzter Beitrag dort von Michael Dirolf (10gen)sagt:
Ich schätze also, Sie können bei einer einzelnen Sammlung bleiben und gute Indexe werden die Arbeit erledigen.
Wie auch immer, wenn die Sammlung zu groß wird, können Sie immer noch einen manuellen Archivierungsprozess ausführen.
