Mongoose versucht standardmäßig, eine ObjectId festzulegen. Dies können Sie wie folgt unterdrücken:
var categorySchema = mongoose.Schema({
_id: String,
ancestors: [{type: String }],
parent: {type: String}
},{ _id: false });
var Category = mongoose.model( "Category", categorySchema );
Und beachten Sie, dass es nur ein Schema für Ihr Layout gibt.